Diseñado como un Programa de Fortalecimiento Institucional Regional, el CIT TDF tiene como objetivo fomentar la creación y consolidación de grupos de investigación enfocados en la generación y transferencia de conocimientos. Esto se logra mediante la activa promoción de la llegada de investigadores capacitados y la formación de becarios doctorales y postdoctorales.

Las actividades del Centro se centran en temas específicos de investigación y transferencia, que tienen en cuenta las necesidades y oportunidades para el desarrollo local. Estas áreas temáticas fueron inicialmente definidas por los actores del territorio, es decir, la Universidad Nacional de Tierra del Fuego y el Gobierno de la Provincia de Tierra del Fuego AEIAS. Estos actores identifican y priorizan un número limitado de áreas socio-productivas estratégicas para alcanzar este objetivo.